记者：那么，三峡工程难道没有一点负面效应吗?
陈祖煜：应该说上面提到的有关泥沙、地质灾害和移民、环境等问题均或多或少包含有负面效应，只是处于受控状态，和三峡工程带来的巨大效益相比，当属次要的地位。
另外，尚有一个实实在在的负面效应，那就是长江的渔业资源在三峡工程建成后确实减产了。特别是中华鲟，仍然处于濒临灭绝的状态。
中华鲟原产卵场位于长江上游干流和金沙江。上世纪60年代，葛洲坝(5.09,0.02,0.39%)水电站建成后截断了中华鲟通往金沙江的水道。为了挽救这一珍贵鱼种，专门成立了中华鲟研究所，开展人工繁殖中华鲟的研究。2009年10月，经过15年的培育，中华鲟幼苗终于出世了。如今这些子二代已经长到1米多长了。我们期待着这一科研成就开花结果。
此外，地质灾害部门对水位变化有严格要求。这样一来，三峡的航运、发电、蓄水等效益都受到制约，无法最大化。水位从145米到175米的升降，这里面的制约因素太多了，学问太大了。
另外，就地后靠移民居住地的地质灾害问题，是当初没有意识到的。实际操作中，才发现这是一个问题。一个大的工程项目，很难保证顺顺当当，很难保证不出现滑坡、塌方、移民上访的问题。但总体来看，蓄水9年来三峡工程应该说比较平稳。
记者：库区水质基本稳定在三类水体，但部分支流出现了富营养化问题，有哪些好的方法和策略治理支流水质?
陈祖煜：支流富营养化属于今后三峡工程要治理的问题。一个是改变当地的生活习惯，目前也有人专门研究一种化肥，不让氮、磷等有机物质大量流入水体。只要愿意投入的话，具体办法很多。
对于这些小支流，工程院院士魏复盛说过一个比较好的办法，就是养鱼，不是网箱养鱼，而是投放养鱼，现在也有很多成功的经验。鱼把富营养的藻类都吃掉了，渔业也发展起来了。现在比较大的问题是，投了鱼苗以后还要知道有没有效果，投放、监测这样一整个的系统，现在没有一个完整的计划。我最近参加了一个乌江的验收项目。他们在投放鱼苗，也不知道效果的好坏。每年几千万尾鱼苗投放进去，没人去管，没人监测。 
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