轨道交通出行将有两条线路。一是南京城市轨道换乘宁启铁路、扬州城市轨道，全程118.8公里，路程约70分钟；另一条是南京城市轨道换乘沪泰宁城际铁路和扬州城市轨道，全程101.5公里，路程约55分钟。

南京人去镇江，也将有两条轨道线路，一是城市轨道换乘京沪高铁和镇江城市轨道，全程90公里，路程约44分钟；另一条是南京城市轨道换乘沪宁城际铁路和镇江城市轨道，全程87公里，路程约32分钟。

此外，南京、扬州、镇江三市也将共同推进轨道交通建设，规划建设宁仪扬都市圈轨道，宁句都市圈轨道、龙潭高资都市圈轨道等轨道线。城市之间的公路路网也将同步加快建设，规划建设龙潭过江通道，实现龙潭与仪征的跨江对接；浦仪高速，浦口仪征之间公路通道“拉直”，里程仅36公里。去年8月，宁镇扬公交一卡通走出了第一步，三市公交卡实现通刷。