4月17日，《21世纪经济报道》曾报道，国家能源局核电司司长郝卫平、煤炭司副司长魏鹏远被有关部门带走调查。报道称，魏鹏远是直接被检察机关带走，可能牵扯到神华集团近期被举报事件。该举报材料揭露部分不法煤炭贸易商不惜花重金买通神华集团运销公司和第三方商检机构有关人员作假、以低卡的神华煤价格购买到高卡神华煤，从而牟取巨额利润的行为，但该消失还有待确认。

财新网今日报道，一位业内消息人士透露，魏鹏远在能源局煤炭司负责项目改造、煤矿基建的审批和核准工作，有可能是这个过程出了问题。

查询部委网站可知，仅2013年至今，就有青海鱼卡矿区鱼卡一井、山西离柳矿区沙曲一号矿井、山西离柳矿区沙曲二号矿井及选煤厂等改扩建项目获得发改委和国家能源局核准。

魏长期在发改委煤炭处工作。2008年国家能源局成立，魏鹏远由煤炭处处长升任为国家能源局煤炭司副司长，属于正处级副司长。核电司副司长郝卫平也在同年由电力处处长升任电力司副司长。

魏鹏远曾鼓励煤电联营。能源局官网资料显示，2011年9月，国家能源局煤炭司副司长魏鹏远曾公开表示，煤电联营将被作为长期政策坚持下去，为鼓励煤电联营深入推进，在项目审核批准方面会有特殊待遇。此后山西省政府下发《山西省促进煤炭电力企业协调发展实施方案》，并专门成立煤炭电力企业协调发展领导组，全面推动煤电联营。后促成多桩交易，如山西同煤集团控股中电投漳泽电力、山西煤炭运销集团与山西国际电力战略重组，山西西山煤电股份有限公司受让华电所属山西和信电力发展有限公司转让的股权。

魏鹏远最后一次公开活动是在2014年1月9日。当时，魏鹏远与国家发改委环资司、财政部税政司等部门领导一行九人，在山东省煤炭工业局局长乔乃琛陪同下，到岱庄煤矿调研。